۱. حافظ نامه شرح الفاظ، اعلام، مفاهیم کلیدی و ابیات دشوار حافظ • وزارت فرهنگ و آموزش عالی،مرکز انتشارات علمی و فرهنگی، چاپ سوم، تهران، ۱۳۶۸ش.، 2 جلد

۲. فرهنگ موضوعی قرآن سرشناسه: کامران فانی نویسنده: کامران فانی • انتشارات ناهید، چاپ سوم، تهران، ۱۳۷۶ش.

۳. فرار از فلسفه زندگینامه‌ خود نوشت‌ فرهنگی‌ • انتشارات جامی، چاپ اول، تهران، ۱۳۷۷ش.

۴. نظری اجمالی و انتقادی به پوزیتیویسم منطقی • وزارت فرهنگ و آموزش عالی،مرکز انتشارات علمی و فرهنگی، چاپ اول، تهران، ۱۳۶۱ش.

۵. پوزیتیویسم منطقی (رهیافتی‌ انتقادی‌) • شرکت انتشارات علمی و فرهنگی، چاپ دوم، تهران، ۱۳۷۸ش.

۶. قرآن پژوهی (هفتاد بحث و تحقیق قرآنی) • مرکز نشر فرهنگی مشرق، چاپ اول، تهران، ۱۳۷۲ش.

۷. تفسیر و تفاسیر جدید • انتشارات کیهان، چاپ اول، تهران، ۱۳۶۴ش.

۸. چارده روایت مجموعه مقاله درباره شعر و شخصیت حافظ • کتاب پرواز، چاپ دوم، تهران، ۱۳۶۸ش.

۹. سهم ایرانیان در تفسیر قرآن • مقالات فارسی - 54، کنگره جهانی هزاره شیخ مفید، چاپ اول، قم، ۱۴۱۳ق.، 100 جلد

۱۰. نبض شعر مجموعه نقد شعر بر هجده شاعر از شاملو تا هیوا مسیح • روشن مهر، تهران، ۱۳۸۳ش.

۱۱. از سبزه تا ستاره مقالات و مباحثی در زمینه قرآن‌پژوهی، حافظ‌پژوهی ، فلسفه/عرفان/دین‌پژوهی ، ادبیات قدیم و جدید، نقد کتاب و طنز و شعر • نشر قطره، تهران، ۱۳۸۶ش.

۱۲. حافظ حافظه ماست • نشر قطره، چاپ سوم، تهران، ۱۳۸۵ش.

۱۳. دانشنامه قرآن و قرآن پژوهی • 2 جلد

۱۴. حیات دوباره ی دیروز درباره رباعی های ایرج زبردست به کوشش: محمد اجاقی • نشر نقطه، تهران، ۱۳۸۵ش.

۱۵. محقق نامه مقالات تقدیم شده به مهدی محقق...به مناسبت گذشت هفتاد سال زندگی و پنجاه سال خدمات علمی و فرهنگی و دانشگاهی به کوشش: جویا جهانبخش • انجمن آثار و مفاخر فرهنگی، تهران، ۱۳۸۶ش.، 2 جلد

۱۶. سیر بی سلوک مباحثی در زمینه دین، فلسفه، زبان، نقد و نشر • انتشارات ناهید، تهران، ۱۳۷۶ش.

۱۷. بررسی ترجمه های امروزین فارسی قرآن کریم • موسسه فرهنگی ترجمان وحی، چاپ اول، قم، ۱۳۸۸ش.

۱۸. تاریخ فلسفه (مترجم جلد 8) مترجم: جلال الدین مجتبوی مترجم جلد 4: غلامرضا اعوانی مترجم جلد 5: امیر جلال الدین اعلم مترجم جلد 6: اسماعیل سعادت، منوچهر بزرگمهر مترجم جلد 7: داریوش آشوری • شرکت انتشارات علمی و فرهنگی، چاپ دوم، تهران، ۱۳۸۵ش.، 9 جلد

۱۹. علم و دین • مرکز نشر دانشگاهی، چاپ دوم، تهران، ۱۳۷۴ش.

۲۰. خدا در فلسفه (برهانهای‌ فلسفی‌ اثبات‌ وجود باری‌) • موسسه مطالعات و تحقیقات فرهنگی، چاپ اول، تهران، ۱۳۷۰ش. • پژوهشگاه علوم انسانی و مطالعات فرهنگی، تهران، ۱۳۸۴ش.

۲۱. عرفان و فلسفه • صدا و سیمای جمهوری اسلامی ایران، انتشارات سروش، چاپ سوم، تهران، ۱۳۶۷ش.

۲۲. اندیشه سیاسی در اسلام معاصر • شرکت سهامی انتشارات خوارزمی، چاپ اول، تهران، ۱۳۶۲ش. • شرکت سهامی انتشارات خوارزمی، چاپ چهارم، تهران، ۱۳۸۰ش.

۲۳. درد جاودانگی (سرگذشت سوگناک زندگی) • نشر البرز، تهران، ۱۳۷۰ش.

۲۴. دایرة المعارف تشیع (ویراستاری) • بنیاد ‌اسلامی‌ طا‌هر، چاپ اول، تهران، بهمن ۱۳۶۶ش.، 2 جلد، ویراستار: احمد صدر حاج سید جوادی و کامران فانی

۲۵. کلیات خمسه نظامی (ویراستاری) مخزن الاسرار، خسرو و شیرین، لیلی و مجنون، هفت پیکر، اسکندرنامه، اقبالنامه سرشناسه: الیاس بن یوسف نظامی شاعر: نظامی گنجوی • خمسه نظامی، دوستان، تهران، ۱۳۸۳ش.، مصحح: سامیه بصیرمژدهی

۲۶. بوق اشغال (مقدمه) گردآورنده: روزنامه جام جم، گروه اجتماعی • روزنامه جام جم، چاپ چهارم، تهران، ۱۳۸۱ش.، 4 جلد

۲۷. فلسفه دین (ویراستاری) مترجم: بهرام راد • انتشارات بین المللی هدی، چاپ اول، تهران، ۱۳۷۲ش.

۲۸. شرح مثنوی معنوی مولوی (ویراستاری) مترجم: حسن لاهوتی • شرکت انتشارات علمی و فرهنگی، چاپ پنجم، تهران، ۱۳۹۳ش.، 6 جلد، با مقدمه: جلال الدین آشتیانی، با تعلیق: حسن لاهوتی