۱. اصول الفقه • دارالتفسیر، چاپ سوم، قم، ۱۳۸۱ش.، 4 جلد • موسسه اسماعیلیان، قم، ۱۳۷۴ش.، 4 جلد • أصول الفقه، بنیاد معارف اسلامی، چاپ دوم، ۱۳۸۶ق.، 2 جلد • اصول فقه، نشر مرتضی، چاپ اول، شهریور ۱۳۶۸ش.، 2 جلد

۲. من أوراق الشیخ محمدرضا المظفر (1322- 1383ه. /1904- 1964م.) • المکتبة العصریة، بغداد، 2007م.، با تعلیق: محمدرضا قاموسی، به کوشش: محمدرضا قاموسی

۳. السقیفة • السقیفة ویلیه علی هامش السقیفة، انتشارات انصاریان، چاپ چهارم، قم، ۱۳۸۲ش.، با مقدمه: محمود مظفر

۴. عقائد الأمامیة • عقائد الامامیه، مکتبة نینوی الحدیثة، چاپ اول، تهران، اشراف: آیة الله سید ابوالقاسم موسوی خویی، با مقدمه: حامد حفی داود • عقائد الامامیه، موسسة الامام علی(ع)، چاپ اول، قم، ۱۴۱۷ق.، محقق: محمدجواد طریحی، با تعلیق: محمدجواد طریحی • عقائد الامامیه، مرکز الأبحاث العقائدیة، قم، ۱۴۲۲ق.

۵. علی هامش السقیفه • السقیفة ویلیه علی هامش السقیفة، انتشارات انصاریان، چاپ چهارم، قم، ۱۳۸۲ش.، با مقدمه: محمود مظفر

۶. المنطق • مطبعة النعمان، چاپ چهارم، نجف، 1968م.، 2 جلد • واریان، قم، ۱۳۸۰ش.، 3 جلد، محقق: سید علی حسینی، با تعلیق: سید علی حسینی، مصحح: سید علی حسینی • موسسه اسماعیلیان، چاپ هفتم، قم، ۱۳۷۵ش.، 3 جلد • انتشارات الهام، تهران، ۱۳۷۷ش.، 3 جلد • مکتبه بصیرتی، چاپ سوم، قم، ۱۴۰۸ش.، 3 جلد • مطبعة النعمان، قم، ۲ش.

۷. المنطق التعلیمی (منهج‌الجدید فی‌ تعلیم‌المنطق‌ للعلامه‌ المظفر) به کوشش: عبدالجواد ابراهیمی • دار الفکر، چاپ سوم، قم، ۱۳۸۲ش.

۸. الفلسفة الاسلامیة • موسسة التاریخ العربی، بیروت، به کوشش: محمدتقی طباطبائی تبریزی

۹. تحفة الحکیم (تحقیق و مقدمه) منظومة فی الحکمة و للعقول نویسنده: آیة الله میرزا محمدحسین غروی اصفهانی (کمپانی) • مؤسسة آل البیت علیهم السلام لإحیاء التراث، قم، ۱۳۷۷ق. • مطبعة النجف، ۱۳۷۸ق.

۱۰. جامع السعادات (مقدمه) نویسنده: محمد مهدی نراقی • کتابفروشی داوری، چاپ سوم، قم، ۲ش.، 3 جلد، مصحح: سید محمد کلانتر • موسسه اسماعیلیان، چاپ سوم، قم، ق.، 3 جلد، با تعلیق: سید محمد کلانتر، مصحح: سید محمد کلانتر

۱۱. ترجمه و تبیین منطق مظفر مترجم: سید علی حسینی • ترجمه منطق مظفر، واریان، چاپ اول، قم، ۱۳۸۱ش.، 2 جلد

۱۲. منطق مترجم: منوچهر صانعی دره بیدی • انتشارات حکمت، چاپ دوم، ویرایش دوم، تهران، ۱۴۰۶ق.